רועי פרץ סיים את תואר הדוקטורט בשנת 2024 בטכניון, מכון טכנולוגי לישראל. מחקרו עסק במידול קונספטואלי וחשיבה מערכתית בתחומי STEM.
בשנת 2006 סיים תואר ראשון במדעי הצמח (B.Sc.) בפקולטה לחקלאות, מזון וסביבה של האוניברסיטה העברית, עם התמחות בגידולי שדה. את התואר השני מהמכללה האקדמית אורנים הוא סיים בשנת 2020 (בהצטיינות יתרה) בהוראת הביולוגיה + תעודת הוראה.
מאז שנת 2015 הוא נמנה על סגל ההוראה במכללה האקדמית כנרת, החוג להנדסת תעשיות מים, שם הוא מלמד קורסים במיקרוביולוגיה וכימיה של המים.